宝安妇幼成立于1986年8月，2003 年通过广东省教育厅、卫生厅临床教学医院评审，2014年成为暨南大学医学院附属宝安妇幼保健院，2015年区委组织部批复成立宝安区妇幼医学研究所，2021年1月评为三级甲等妇幼保健院。
省级1个（儿童心理保健专科为广东省儿童心理保健示范单位）；市级2个（新生儿科为深圳市十大优势医学重点学科群组成单位、中心实验室为深圳市重点实验室）；区级4个（产科、儿科、新生儿科为区级重点学科，中心实验室为区级医学重点学科建设单位）。
医院现有职工1130人，其中高级职称205人；博士后2人，博士30人，硕士188人；博士生导师4名，硕士生导师6名；地方性领军人才1人，深圳市后备人才1人，宝安区高端人才13人、高层次人才42人。
智慧医院：2017年，中国妇幼保健协会授予宝安妇幼“智慧妇幼数字医院示范单位”称号，成为全国首家获得该称号的妇幼保健机构。“智慧妇幼”上线后，平均每位患者在院停留时间缩短了100分钟左右。
秉承“无偿捐献，无偿使用”的纯公益原则，建立了深圳市公益性母乳库。
