深圳市中医院始建于1975年，包含福田院区、光明院区、罗湖院区、针灸推拿分院和科教中心“一院五区”，是全国首批三级甲等中医医院、广州中医药大学首家非直属附属医院和广州中医药大学第四临床医学院。
医院在国家三级公立中医医院绩效考核中连续5年获得最高考核等级A+，其中2021年、2022年分别获得全国第5（全省第1）和8名（全省第2）；先后获批国家中医药传承创新工程重点中医医院、国家区域中医肝病诊疗中心、粤港澳大湾区中医药临床传承创新研究中心、深圳市中医临床医学研究中心；成为广东省高水平医院重点建设医院、广东省现代医院管理制度试点单位、广东省公立医院改革与高质量发展示范医院。
光明院区实行“同质+”管理，暨行政管理一体化、人力资源一体化、医疗管理一体化、信息系统一体化、运营保障一体化、文化建设一体化；在确保与福田院区提供同质化医疗服务水平的同时，形成不同院区间差异化发展。当前，医院正围绕争创国家中医临床医学研究中心和建设国家区域中医诊疗中心的目标，力争打造医疗、教学、科研、预防、保健、康复、转化“七位一体”协同发展的现代化、国际化、智能化、研究型高水平医院和粤港澳大湾区中医医疗中心，在建设一流的中医药传承创新城市和国家中医药综合改革试验区发挥更大作用。
光明院区于2014年9月正式立项，总建筑面积44.02万平方米，规划床位2000张，将于6月28日正式开启门诊试运营，这标志着深圳市中医院在多院区规划布局中迈出了坚实的一步。光明院区按照“绿色医院”建设标准，充分融合了传统中医文化，整体具有院落式的整体布局、仿古系的诊疗环境以及灵活型的交通组织等特点，致力于打造“全新的医疗服务模式”。
光明区位于广深港发展中轴，是广深科技创新走廊的重要节点，也是粤港澳大湾区核心区域之一，广东省国家中医药综合改革示范区试点城市。深圳市中医院光明院区的启用，将助力光明区进一步提升医疗资源质量，带动区域中医体系的发展，并面向粤港澳大湾区，发挥中医医疗中心作用，为百姓提供更高水平、更高质量的优质中医药服务。
光明院区位于深圳市光明区长圳路东218号，2024年6月28日正式启用，首期开放科室涵盖了多个中医特色科室和平台科室，以及配套的中医药服务和研究设施，为光明区、深圳市及粤港澳大湾区市民提供更高水平、更高质量的中医药医疗服务：
深圳市中医院光明院区不仅为患者提供了一个温馨、舒适的就医环境，更以其全面的中医特色科室和优势学科群，为粤港澳大湾区乃至全国中医药传承创新发展贡献宝贵的“深圳方案”和“深圳智慧”。
