上海爱尔眼科医院作为爱尔眼科医院集团下属旗舰医院，于2005年8月在上海市长宁区虹桥路1286号开业，2021年迁建至徐汇区吴中路83号。医院参照三级眼科标准设置，总面积35000多平方米，编制床位数120张。设有眼底病专科、老视白内障专科、青光眼专科、屈光科、斜弱视与小儿眼病专科、视光专科、角膜及眼表专科、眼睑眼眶与眼整形专科、综合眼病科、功能影像科、药剂科、检验科、麻醉科等近二十个临床和医技科室，除普通门诊外，还开设眼科急诊及多个专家门诊，同时设有10个职能部门；5个护理单元；1个党支部。是上海市医保定点机构。院内设有宣教室、科研室、国际学术会议中心等，是一家集医疗、教学、科研和学术为一体的专业眼科医院，致力于打造长三角区域颇具影响力的眼科医院。
医院配有与国际化诊疗设备接轨的医疗设备，包括上海地区首台美国强生眼力健白力士Catalys白内障飞秒激光超声乳化系统、阿玛仕准分子激光角膜屈光治疗机、蔡司VisuMax全飞秒激光、爱尔康EX500准分子激光系统、爱尔康FS200激光角膜手术系统、超声乳化仪、玻璃体切割机、532眼底激光机、YAG激光机、蔡司手术显微镜,莱卡手术显微镜、眼底照相及眼底荧光血管造影和脉络膜血管造影仪、欧堡P200T全景200广
