重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，国家儿童区域医疗中心（西南）、国家一流本科建设单位、国家临床医学研究中心。
医院是最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授予点、博士后流动站，是首批儿科学国家重点学科、教育部重点实验室、国家级国际科技合作示范基地、国家级继续医学教育基地、国家级教学团队、国家精品课程、国家食品药品监督管理局药物临床试验机构、全国儿科唯一的住院医师规范化培训示范基地；国家级儿童早期发展示范基地、儿科唯一获得肝移植资质的儿童医院、国家干细胞临床研究备案机构；拥有5个重庆市重点实验室和重3个工程中心,全国文明单位。在全国最佳医院排行榜中连续多年位居全国儿童医院第三位，2018年度儿内科综合排名居全国儿童医院第三位，儿外科居第三位，科研产出居第一位。2019年中国医院科技量值(SETM)排名中，我院综合居全国儿童医院第三位、儿科学居第二位。
医院现有教职员工4000余名，博士生导师46名，高级职称专家302名、享受政府特殊津贴专家15名。是中华医学会儿科学分会常委单位、中华预防医学会儿童保健分会副主任委员单位，是《中华儿科杂志》、《中华小儿外科杂志》等杂志副总编、副主编单位及国内10余家杂志副总编和编委单位；是国家规划教材《儿科学》第六版主编和第七、八版副主编单位。
医院是国家儿童区域医疗中心。现有渝中院区和两江院区两个院区，共编制床位2480张。平均开放1925张。2019年门急诊量337.24万人次，住院量9.53万人次，外埠病人比例近40%。儿童重症医学、小儿呼吸科、新生儿科、小儿外科、儿科临床护理获国家临床重点专科建设项目。
儿科学院是国规模最大的儿科医师培养基地和全国住培示范基地，2019年首批获批国家一流本科专业建设点，年招收本科、硕士、博士研究生400-500名，进修生及规范化培训人员200-300名。执业医师考核通过率达到94%以上，高于全国平均值25个百分点，住培医师结业考率通过率100%。
儿科研究所为医院科研的重要基地，2019年正式获批国家临床医学研究中心、是发育与疾病教育部重点实验室，有万人计划、教育部“长江学者”讲座教授、重庆市首届“两江学者”等人才称号10余名。医院保持了全国儿科学科学研究的先进地位：2019年发表SCI论文186篇，获得自然科学基金21项。
医院高度重视国际交流与合作，已经与英国伦敦大学学院ICH儿童健康研究所 、美国辛辛那提儿童医院医学中心、新加坡竹脚妇幼医院等10多所所国外一流大学、科研机构建立了稳定的合作关系。
医院主动承担社会责任，参与公益活动。援助巴巴多斯，对口援助“西藏昌都市人民医院”等，扶贫获国家卫生健康委表彰。
医院以国家需求为导向，以学科研究为引领，以组织绩效目标管理为主线，以仁心仁术为服务理念，推进医院保持国家一流水平向前发展。
