医院创办于1958年，1996年通过“二级甲等医院”和“国家爱婴医院”评审，2010年3月升级为深圳市坪山新区人民医院，2017年7月更名为深圳市坪山区人民医院，是集医疗、急救、预防、保健、康复、教学、科研为一体的区级综合性医院。拥有广东省高等医学院校教学基地、广东省全科医师临床教学实践基地资质。为广州医科大学、广东药科大学、湖北医药学院临床教学医院和武汉大学公共卫生学院创新实践基地。是香港大学深圳医院对口合作单位，坪山区与南方医科大学合作共建的医疗健康集团（南方医科大学坪山总医院）核心医院。
2019年9月，坪山区人民政府与南方医科大学签订《合作共建坪山区医疗健康集团协议》，坪山区人民医院成为坪山区与南方医科大学合作共建的医疗健康集团核心主体。医院在坪山区委区政府和南方医科大学的领导下，在上级主管部门精心指导和社会各界的大力支持下，坚持“精医重道、至诚至善”办院理念，以建设群众满意的医院为目标，加强基础建设，强化内部管理，不断提高医疗质量和服务水平，经过不懈努力，医院规模不断扩大，医疗环境明显改善，群众满意度稳步提高。
作为坪山区与南方医科大学合作共建的医疗健康集团核心主体，坪山区人民医院将充分发挥南方医科大学的学科人才和技术平台优势，通过探索建立政校联合、医防融合、医康整合、医养结合的医疗卫生与健康服务新模式，为坪山市民提供高质量、全方位、全生命周期的医疗健康服务。
医院将牢牢把握广东省、深圳市打造广深医疗高地，以及深圳实施“东进战略”和坪山成立行政区后大建设大发展和打造区域特色医疗中心的历史机遇，适应辖区经济社会发展要求和群众不断增长的医疗服务需求，近期将通过在现址实施二期改造项目，加快医疗设备升级换代，全力推进就医环境、服务水平、医疗水平、服务质量明显提升，不断改善辖区群众就医体验和社会评价。中长期，将根据深圳市和坪山区已经确定的医院整体迁址新建项目规划，按照2000张床位的规模和三级甲等医院标准，加快推进新院区建设，努力将医院建设成为群众满意、放心的人民医院。
2017年挂牌成为湖北医药学院第八临床学院、湖北医药学院附属深圳坪山医院、湖北医药学院药护学院附属深圳坪山医院，实现坪山区医学院校附属医院“0”的突破；成功导入广东省医疗质量巡查服务体系，在全市首次公立医院综合评价之二级综合医院中排名第三名，其中竞争力排名第三名、公益性排名第四名，荣获2017年广东省县域（区）优秀医院管理团队奖，获评2017年全国综合医院中医药工作示范单位。2018年取得广东省医疗服务质量评估区级考核第一名；5月12日挂牌成为上海复旦大学附属华山医院陈星荣影像会诊中心深圳分中心；荣获2018年度深圳市院前急救、急诊综合考核A级单位；获评2018年度坪山区爱婴医院先进单位；荣获2019年度深圳市院前急救、急诊综合考核A级单位。医院还先后荣获市级“健康促进（金奖）医院”、“医患和谐示范岗”“巾帼文明示范岗”“先进基层党组织”等荣誉，连年受到市卫生健康委表彰。
医院现有泌尿外科、骨科、儿科、耳鼻喉科、麻醉科5个区级重点学科。此外，神经外科、胃肠外科、放射介入、无痛诊疗和全科医学业务也得到快速发展。
