重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授予点、博士后流动站，是首批儿科学国家重点学科、国家精品课程、国家级教学团队、教育部重点实验室、国家食品药品监督管理局药物临床试验机构，是重庆市重点实验室、重庆市国际合作交流基地、重庆市干细胞治疗工程中心。多次被评为全国卫生系统先进集体、全国精神文明建设工作先进单位和全国师德建设先进单位。在全国最佳医院排行榜中，连续三年排名前50强，在全国儿童医院蝉联排名第三位，专科声誉排名重庆市第一位。
医院的宗旨：一切为了儿童健康，医院的愿景和目标：建立国内一流、国际先进的儿童医学中心，医院的院训：严谨、求实、创新、奉献，医院的定位：立足重庆、面向西部、辐射全国、走向世界，成为区域儿科医疗、教学、科研的典范。
现有员工2344名，博士生导师23名、高级职称专家233名、享受政府特殊津贴专家14名。是中华医学会儿科学分会、儿外科分会、围产医学分会和中华预防医学会儿保分会领导成员、《中华儿科杂志》主编和副主编单位、全国统编教材《儿科学》第六、七、八版教材主编、副主编单位。是重庆医学会儿科分会、儿外科分会、康复学会、妇幼营养专委会主任委员单位。
医院编制床位1400张，2012年门诊量170万，年住院病人5。5万，外埠病人比例达34%。医院专业设置齐全，是全国联网的儿童急救中心、重庆市哮喘防治中心、危重新生儿及早产儿急救中心、重庆市儿童营养研究中心、重庆市新生儿筛查机构。共有42个临床和医技科室，ICU、呼吸、新生儿、小儿外科、临床护理获国家临床重点专科建设项目。小儿临床免疫、儿童保健、泌尿外科、手术麻醉科是重庆市医学重点学科，神经内科、心血管内科、儿童肿瘤科是医院重点专科。儿童肝移植、原发性免疫缺陷病异基因骨髓移植、HIFU治疗实体瘤、临床分子诊断技术居全国领先水平。
儿科学院是全国规模最大的儿科医师培养基地和儿科学国家级继续教育基地，承担着临床医学（儿科方向）本科、硕士、博士、博士后教育及临床进修、医师规范化培训等教学任务。年招收本科、七年制、硕士、博士研究生400-500名。拥有先进、齐备的教学设备和临床技能训练室供学员学习和模拟训练。
儿科研究所为医院科研的重要基地，以“发育与疾病”为主线形成“免疫与感染”、“神经精神疾病”、“先天畸形与组织工程”、“肿瘤发病机制与个体化治疗”四大方向，初步形成基础与临床相互合作与渗透的构架，团队引进多名加拿大UBC（包括皇家科学院院士和健康科学院院士各1名）和其他海外大学高端科研人才，荣获重庆市首届“两江学者”、中组部“千人计划”、教育部“长江学者”讲座教授称号等。近五年，获国家自然科学基金中加合作重大项目、重点项目和面上项目居儿科界前列，获科技部“863”计划、国家“科技支撑计划”、“卫生行业科研专项”合作项目10余项、承担“973”子课题3项。获重庆市科技进步一等奖、教育部科技进步二等奖、“宋庆龄儿科医学奖及成果奖”、中华医学奖等30余项。近三年发表SCI200余篇、CSCD论文453篇。主办《儿科药学杂志》。
医院高度重视对外交流，坚持开放合作，先后与美、英、加、日、澳、香港等20多个国家和地区学术机构建立了友好合作关系，与美国辛辛拉提儿童医学中心建立长期全面合作关系。近三年成功举办国际学术会议5次。
医院主动承担社会责任，参与公益活动，申请到“明天计划”、“微笑列车”、“重生行动”、“肢残儿童矫治计划”、神化集团捐赠“白血病基金”、重庆市红十字会“白血病基金”、“重庆市急救医疗救助基金、“先天性心脏病救治基金”等各种基金项目，并牵头于2009年建立“重庆市希望工程---小天使基金”，减免贫困疾病儿童诊治费用，为缓解贫困疾病儿童看病难做出了积极贡献。
医院坚持医疗立院、科教兴院、人才强院、依法治院、文化建院，立足重庆，面向西部，辐射全国，以儿童健康为中心，持续改进工作，医疗与预防并重，技术与服务并重，医疗与科教并重，自身发展与带动基层并重，用科技和关爱为儿童健康提供优质服务。
