深圳市人民医院始建于1946年，前身系宝安县卫生院，解放后更名为宝安县人民医院，因粤港澳居民称住院为“留医”，她作为当时深圳经济特区唯一一家拥有住院部的医疗机构，医院亦被居民习称为“留医部”，并成为深圳市人民医院的代名词沿用至今。1979年伴随深圳经济特区成立更名为深圳市人民医院。1994年被评为深圳首家“三级甲等”医院，1996年经国务院侨办批准成为暨南大学医学院第二附属医院，2005年升格为暨南大学第二临床医学院，2018年挂牌南方科技大学第一附属医院。现已发展成为一个功能齐全、设备先进、人才结构合理、技术力量雄厚，集医疗、科研、教学、住院医师规培、保健为一体的深圳市最大的现代化综合性医院。
医院占地面积124914.52平方米，建筑面积30余万平方米，开放床位3000余张，在岗员工5000余人，其中具有高级资格1000余人，中级资格1200余人，医师研究生以上学历占比61.5%；博士生导师24人，硕士生导师115人。2019年出院病人11.3万人次，诊疗人次363.3万人次。
医院拥有呼吸与危重症医学科、肾内科、消化内科、感染内科、内分泌科、胸外科、口腔科、麻醉科、妇科、产科、新生儿科、急诊科、病理科、检验科、临床护理及医学影像科(含CT、放射、超声、介入、核医学)等16个广东省临床重点学科；2个广东省工程技术研究中心；拥有14个深圳市重点医学专科及7个市优秀重点学科群、3个研究所、3个深圳市医学重点实验室、5个深圳市工程技术研发中心、1个国家级临床药物试验基地。2003年，率先引进中国大陆第一台“宙斯ZEUS”手术机器人，并于2004年4月完成了中国大陆第一例机器人腹腔镜胆囊切除术，填补了我国大陆在这方面的空白，2013年介入微创诊疗中心被评为亚洲冷冻治疗培训基地，2014年胸外科完成了世界首例单孔全胸腔镜肺段袖式切除术，该项技术在SCI的发表标志着肺癌根治术，尤其是早期肺癌根治手术跻身国际水平。2015年9月顺利通过第五批中国胸痛中心认证，正式获批“中国胸痛中心”医院，2015年10月成功验收人类辅助生殖中心，凭着医院的整体医疗技术水平，吸引了香港、澳门以及深圳周边地区的大批患者，受到国内外媒体广泛关注。2017年1月被认定为“广东省产前诊断专项技术指导中心”、“广东省重症孕产妇救治中心”和“广东省重症新生儿救治中心单位”，12月，被授牌为“广东省智慧医院建设单位”，同时以优异的成绩通过“三级甲等”医院复审。同年被国家卫生计生委、广东省卫生计生委评为“改善医疗服务行动计划”示范医院。2018年6月，获广东省政府、省卫计委遴选为全省首批九家“登峰计划”建设医院之一。2019年成功引进TOMO 螺旋断层放射治疗系统和第四代达芬奇手术机器人（均为深圳首台）。
医院拥有国家住院医师规范化培训基地及国家全科医师技能培训中心；作为暨南大学第二临床医学院、暨南大学第二临床医学院博士后创新实践基地。医院呼吸与危重症医学科经过严格遴选成为国家首批、广东省广州市外唯一的国家专培基地。2015年成立了深圳市人民医院转化医学协同创新中心，将整合所有重点实验室、医学工程中心（平台）和博士后教育基地，解决应用不连贯的问题，建设统一的免疫生化、分子生物、基因检测和动物模型建设的基础实验室，同时因应各专科需求增设特异功能装备，并以此作为我院的主要科研基地，进行医院重大临床研究和临床技术研究。2017年获国家科技进步奖二等奖一项，包揽了“深圳市第一届住院医师规范化培训临床技能竞赛”团队一等奖、二等奖及全部单项奖冠军，2018年度深圳市医院科技影响力排行（综合医院）第一，第一届广东省住院医师规范化培训临床技能竞赛的团队特等奖和五个单项一等奖。医院现有内科学、外科学、妇产科学、儿科学等16个教研室。
多年来，医院不断选送有培养前途和发展潜力的专业技术骨干前往美国耶鲁大学、加州大学、斯坦福大学、纽约长老会哥伦比亚与康奈尔大学医院、迈阿密大学医学院、宾州大学医学院、哈佛大学医学院（ 附属麻省总医院、贝丝以色列女执事医学中心）、休斯顿卫理公会全球健康服务中心，德国雷根斯堡大学医院、英国桑德兰大学、比利时布鲁塞尔大学、澳大利亚科廷大学、加拿大SFU大学、新加坡国立大学医院、香港中文大学威尔士亲王医院、香港大学玛丽医院等国际知名学府进修学习，掌握本专业的新知识、新技能、新动态，全方位加深对医学科学的认识和了解，莘莘学子在国际医学领域中锤炼成长。
医院积极开展高层次、国际性的交流与合作，先后与德国纽伦堡大学医学院、不莱梅港中心医院、英国伦敦大学、英国爱丁堡大学、加拿大西大略大学器官移植中心、美国休斯敦卫理公会医院、法国里尔大学医疗中心、韩国全南大学校病院、韩国大田宣医院建立起长期合作与交流平台，缔结友好医院，与国际医学大舞台进一步交融。国内交流与合作：医院与广州呼吸疾病研究所钟南山院士呼吸内科团队、中国医科大学附属第一医院徐克教授介入科团队、北京大学第一医院霍勇教授心内科团队、四川大学华西医院刘进教授麻醉科团队、北京大学第一医院丁炎明教授护理团队、苏州大学附属第一医院江苏省血液病研究所阮长耿院士血液内科团队、复旦大学附属华山医院顾玉东院士手外科团队、首都医科大学北京医学中心耳鼻咽喉医院韩德民院士耳鼻咽喉团队、山东大学齐鲁医院张运院士超声心动图团队、Robert Malenka院士脑认知科学团队、北京协和医院曾小峰教授风湿免疫团队、伦敦大学学院加里罗伊尔教授肿瘤学团队、美国西北大学Seema Khan教授及约翰霍普金斯教授乳腺外科团队、军事医学科学院金宁一院士病毒学研究室团队、英国爱丁堡大学Andrew Morris 教授糖尿病研究团队、南方医科大学丁彦青教授病理团队、中山大学第六附属医院汪建平教授胃肠肿瘤团队、美国Jackson实验室阮一俊教授精准医学团队、广州医科大学附属第一医院黎毅敏教授重症医学团队、第二军医大学附属长海医院李兆申教授消化内镜创新团队、北京医院王建业教授衰老及相关疾病研究团队、牛津大学纳菲尔德学院Chris Redman教授产科团队、北京清华大学长庚医院董家鸿院士肝胆胰外科团队等共23家知名学科团队签订“三名工程”合作协议，加大了引才的力度，为医院带来了前所未有的发展机遇，医院的综合竞争力大大提高。
